أحاطت قطر جماعة الإخوان المسلمين رأس أفعى الإرهاب بالمنطقة العربية بالكثير من العناية والرعاية، حيث أظهر تقرير لسكاي نيوز عن أنها قدمت الدعم المالي والإعلامي للجماعة في مصر، ودعمت خلايا إرهابية في مصر أغلب عناصرها من الإخوان، وعينت مستشارًا خاصًا لأمير قطر كان مكلفًا بالاتصال بالإخوان.
ولم يتوقف الدعم القطري للإخوان عند هذا الحد، حيث قامت بدعم المظاهرات المؤيدة للرئيس المعزول محمد مرسي، ورفض طلب مصر تسليم قيادات إخوانية مدانة.
كما أسست جماعة الإخوان عدة جماعات تحت غطائها كداعش، والقاعدة، وجبهة النصرة، وبوكو حرام.